Lo Yoismo è stato fondato nel 1994 nell'area di Boston, Massachussets. Il primo scritto postato sul sito dello Yoismo è la presentazione del 27 ottobre 1998 The Word According to Yo, as Told to Daniel del Dott. Daniel Kriegman. L'articolo assume che in aggiunta al dott. Kriegman vi erano altri Yoisti coinvolti nello Yoismo in quel periodo. Per allora Isaac Kriegman, uno dei fondatori dello Yoismo e programmatore open source, aveva portato il concetto di open source nello Yoismo come modello di sviluppo per un sistema religioso universale.

Il seguente successo di Wikipedia, che dimostrò la possibilità per un modello decentralizzato e open source di creare un deposito affidabile della conoscenza umana, ha portato il modello libero ad imporsi come nucleo centrale dello Yoismo.

Yo, Inc. è una organizzazione non profit costituita per promuovere lo Yoismo. L'8 marzo 2005, la Yo, Inc. venne riconosciuta come associazione di pubblica carità dalla U.S. Internal Revenue Service (con effetto retroattivo al 30 dicembre 2002).